Действует с 1 сентября 2024 г.
Приложение № 2. Форматы предоставления информации в государственную информационную систему в области генетической информации "Национальная база генетической информации"
Срок действия
Действует до 1 сентября 2030 г. (п. 3 постановления). С 1 сентября 2030 г. не действует. Открыть документ на 01.09.2030 →
Ниже текст действующей редакции.
| Входная информация | Формат предоставления информации* | ||
| Файлы генетических данных, в том числе: | SFF, HDF5, FAST5, FASTQ (.fastq, .fq), SAM (Sequence Alignment/Map), BAM, CRAM | ||
| данные секвенирования | |||
| геномные сборки и нуклеотидные последовательности | FASTA (.fnt, .fna, .faa, .fa, .fas, .fasta) | ||
| аннотированные последовательности | GFF2 (General Feature Format version 2), GTF (Gene Transfer Format), GFF3 (General Feature Format version 3) | ||
| данные о структурных вариациях в геноме | VCF (Variant Call Format) | ||
| данные геномных треков | BED (Browser Extensible Data), bedGraph, WIG (Wiggle Track Format), bigwig (bigWig Track Format), bigBed (bigBed Track Format) | ||
| данные трехмерной структуры молекул | PDB (Protein Data Bank), PDBx/mmCIF | ||
| Файлы для массовой загрузки генетических данных | csv, tsv | ||
__________________________
* Указанные форматы являются общепринятыми и поддерживаются наиболее распространенным оборудованием или свободно распространяемыми инструментами.